埋线方位把握感不好，可能出现凹陷或神经损伤
"穴位埋线"要求将羊肠线一半植入脂肪层，一半植入肌肉。如果失当，线单纯植入了脂肪层，就会引起脂肪液化，埋线部位会因此而出现凹陷。倘若扎错了穴位，严重的还会损伤人体的神经。根据规定，这种侵入性的、并对人体产生创伤的行为，属于医疗行为，施针者必须持有《医师资格证书》和《医师执业证书》，地点规定在医疗机构内。若在医院外诊疗，要经过卫生行政部门批准和备案。
另外，中医对于肥胖因素分为多型，如有脾虚痰湿型，表现症状是倦怠乏力、肌肉松弛，虽然胃口不好，食不下咽，但还是照样肥胖。脾胃实热型，口臭、、尿黄，肌肉结实，且食量大，容易饥饿。
肝阳上亢型，多伴有高血压、睡觉多梦及脾气暴躁等症状。还有脾肺肾气虚型，多汗、倦怠嗜睡、腰膝酸软无力、下肢水肿或是全身水肿，俗话所说的，"喝凉水也会长肉"便属此类。冲任失调型，症状是出现月经失调，臀部胖如水肿。血瘀型，常见于车祸或挫伤后开始的肥胖。
钢针不严格
"穴位埋线"主要的器械是钢针和羊肠线，对于这两种器械，国外已经当作一次性用品，国内正规医院也都提倡患者使用一次性针，虽不作强求，但至少要做到一人一针，使用后要经过的高压蒸汽，而这一点不正规医院是很难做到的。一般医院大都是把钢针放在酒精里浸泡，但酒精只能杀灭，对于乙肝、丙肝等病毒是不起作用的。
尤其是在挥发后的酒精浓度，可能还达不到75%，效果就会更差。而钢针插入人体穴位后，可能会碰破，所以，如果在重复使用时，钢针没有经过的高温高压，人与人之间，很易互相传播血液类疾病，易传染的疾病是乙肝和艾滋病。